Áreas Protegidas por Zonas

Zona Central

1. Parque Nacional La Tigra
2. Parque Nacional Montaña de Yoro
3. Parque Nacional Montaña de Comayagua
4. Parque Nacional Cerro Azul Meámbar
5. Parque Nacional Sierra de Agalta
6. Reserva Biológica Misoco
7. Reserva Biológica Montecillos
8. Área de Uso Múltiple Lago de Yojoa
9. Reserva Biológica El Chile

Zona Norte

1. Parque Nacional Pico Bonito
2. Parque Nacional Punta Sal
3. Parque Nacional Punta Izopo
4. Refugio de Vida Silvestre Cuero y Salado
5. Parque Nacional Capiro y Calentura
6. Parque Nacional Cusuco
7. Jardín Botánico Lancetilla
8. Refugio de Vida Silvestre Laguna de Guaimoreto
9. Refugio de Vida Silvestre Texiguat
10. Monumento Cultural Fuerte de San Fernando de Omoa

Zona Sur

1. Área de Uso Múltiple Isla del Tigre
2. Área de Manejo de Hábitat por Especie Bahía de Chismuyo
3. Área de Manejo de Hábitat por Especie Bahía de San Lorenzo
4. Área de Uso Múltiple Cerro Guanacaure
5. Área de Manejo de Hábitat por Especie Las Iguanas Punta Condega
6. Área de Manejo de Hábitat por Especie Los Delgaditos
7. Área de Manejo de Hábitat por Especie El Jicarito
8. Parque Nacional Marino Archipiélago del Golfo de Fonseca
9. Área de Uso Múltiple La Botija

Zona Oriental

1. Reserva Antropológica El Carbón
2. Reserva Forestal Mocorón
3. Reserva Biológica Laguna de Caratasca
4. Reserva Biológica Rus-Rus
5. Parque Nacional Patuca
6. Parque Nacional Warunta
7. Reserva de Biosfera de Río Plátano
8. Reserva de Biosfera Tawahka
9. Parque Nacional Cayos Mismitos
10. Reserva Marina Islas del Cisne

Zona Occidental

1. Refugio de Vida Silvestre Puca
2. Monumento Natural Congolón
3. Reserva Biológica El Pital
4. Reserva Biológica Volcán Pacayita
5. Parque Nacional Celaque
6. Monumento Cultural Ruinas de Copán
7. Reserva Biológica Guisadote
8. Parque Nacional Trifinio-Montecristo
9. Parque Nacional Cerro Azul Copán
10. Refugio de Vida Silvestre Erapuca

Zona Insular

1. Refugio de Vida Silvestre Santa Elena
2. Reserva Marina Turtle Harbour
3. Refugio de Vida Silvestre Cayos de Utila
4. Reserva Marina Barbareta
5. Refugio de Vida Silvestre Port Royal
6. Parque Nacional Marino Cayos Cochinos
7. Reserva Marina Sandy Bay